Biological Collection Access Services
Source: http://www.biocase.org/
Biological Collection Access Service Euroopas, BIOCASe, on rahvusvaheline võrgustik bioloogilist kollektsiooni igasuguseid.BIOCASe võimaldab laialdast ühtset juurdepääsu laiali ja heterogeenne Euroopa kogumine ja vaatlused andmebaase kasutades avatud lähtekoodiga, süsteemi sõltumatu tarkvara ja avatud standardeid ja protokolle.
Uus põhiversiooni BIOCASe Provider Software on vabastatud. Kuna oluline uus funktsioon, version 3 saavad nüüd luua XML arhiivides, et salvestada kõik andmed avaldatud BIOCASe veebiteenus ühes failis. Kui vaja, need arhiivist saab muuta DarwinCore Arhiivi järgnev samm.
Lisaks hulk väiksemaid muutusi ja optimeerimine on rakendatud. Metadata ülekanne on nüüd ka toetatud Oracle andmebaase, mis võimaldab lihtsam konfiguratsiooni vastavalt veebiteenused. Täieliku muudatuste nimekirja leiateversiooniajalugu.
Uus versioon Provider Software on vabastatud. Nüüd enamus konfiguratsiooni lehekülge funktsioon "Help" link, mis viitab otse vastava juhendaja uue PyWrapper dokumentatsiooni wiki. Peale selle sisaldab mitmeid väiksemaid veaparandusi leiateversiooniajalugu täieliku nimekirja.
Uus PyWrapper dokumentatsiooni wiki on nüüd internetis aadressil http://wiki.bgbm.org/bps. See on ümber kirjutatud täiesti nullist viimane versioon BIOCASe Provider Tarkvara (2.6.0).
See sisaldab mitu samm-sammult õpetused paigaldamine, konfigureerimine, silumine, ettevalmistamise andmebaasi publikatsiooni BIOCASe, algaja juhend, lühike dokumentatsiooni ABCD ja korduma kippuvaid küsimusi. Palju lehti tulemasversion of Provider tarkvara hõlmavad "Help" link, mis viitab otse vastava lehe online dokumentatsiooni.
Versioon 2.6 Pakkuja Software on vabastatud. See pakub suuri muutusi kasutajaliides konfiguratsiooni vahend, mis peaks lihtsustama setup BPS märgatavalt. Tabel setup on tervikuna ümber; tabeli ja veeru nimed nüüd teha väljavõtteid andmebaasi ja kuvatakse rippmenüü-kastid levinud DBMS. Kaardistamise editor kasutab ka rippmenüü-box nüüd.
Kui MySQL või postgres kasutamisel Pakkuja tarkvara nüüd ära OFFSET SQL klauslite teenindavad Otsi päringud, mis suurendab jõudlust korjamiseks rakendusi. Last but not least, mitmed vead on fikseeritud. Vaata Version History täieliku nimekirja muudatusi.
OpenUP! Projekti alustati märtsis kasutab BIOCASe Technology ühendada miljoneid Multimeediumobjekti salvestatud loodusteaduslike kollektsioonide Euroopa võrgustiku Europeana, muutes need kättesaadavaks avalikkusele kvaliteetne.
Selleks et luua vajalikud teadmised seotud projektipartnerid, kaks päeva käed-seminar 30. mail ja 31. at Botanic muuseum Berliinis õpetada paigaldamist ja seadistamist BIOCASe Provider Software. 17 inimest 9 riigist nüüd kasutada oma teadmisi, et luua BIOCASe käitiste oma institutsioonid.
Itaalia kavatseb rajada oma BIOCASe põhinevad bioloogilise mitmekesisuse võrku. Rahastab Keskkonnaministeerium, esimese etapi projekti mitu andmeesitajate avaldab vähemalt 1 miljoni plaadi. BIOCASe Provider Software kasutatakse sööda proov teavet andmeesitajate keskse sõlme, mis seejärel levitada andmeid BIOCASe võrgu-ja GBIF.
Selleks et luua kohalik BIOCASe teadmisi, käed-seminar on March 2. ja 3. Roomas. Ülevaade Sisearhitektuur mitmekesisuse võrgustikke, põhimõtteid ja standardeid kasutada anti. Teisel päeval osalejad paigaldanud oma BIOCASe näiteks kohaliku arvuti ja konfigureeritud avaldamist väike kollektsioon andmebaasi. Kui töötab, neid kasutati luua väike, kohaliku bioloogilise mitmekesisuse võrgustik prototypic andmete portaal võimaldab hajutatud päring.
Lisaks BIOCASe feed annab AVH andmed Atlas of Living Australia, kelle andmed portaal hakkab toimima sel sügisel.
Seetõttu LifeWatch viib läbi online küsitlus. Küsimused tegelevad peamiselt LifeWatch "Teenused" ja kõik funktsioonid LifeWatch võiksid pakkuda. Täites küsimustiku kestab umbes 20 minutit. Lõpus vastanutest saab teatada, kas nad soovivad olla kursis tulemuste ja tellimise LifeWatch Newsletter.
See tarkvara võimaldab hõlpsasti paigaldada ja seadistada oma veebiportaali juurdepääsu bioloogilise mitmekesisuse andmeid.
tarkvara pakub erinevaid võimalusi seadistada veebiportaali. Configurable funktsioonide hulka proovist ja seire andmebaasi (rakendatakse kas MySQL või MS-SQL ja põhineb GBIF-Index); kuvada metaandmete (nt andmeid pakkujad, institutsioonide ja kogud) ning laienduse käigus kasutatakse taksonoomilise andmebaasid rakendamisel TOQE protokoll.
kasutajaliidese disain saab muuta ka muutmata üherealine programmi koodi.
Lisateavet selle kohta, kuidas hankida ja installida tarkvara palun saata sõnum support@biocase.org.
See üleminek koos väikeste muudatuste tegemise alusandmeid mudel, märgatavalt parandada need portaalid. Andmed on veel saadud mySQL baasil GBIF indeks.
uurimine mitmekesisuse sõltub isendite kasutamine. Need isendid on toimunud võrdluskogude üle maailma. BCI on keskne indeks need kogud ja oli algatatud oktoobris 2007 by Roger Hyam kui vastust tööd Ülemaailmselt Kordumatud tunnused ja looduspärandi kollektsioonid kirjeldused, mis juhtus jooksul bioloogilise mitmekesisuse Information Standards (TDWG).
bioloogilise mitmekesisuse Service & Application Tracker on kogumik linke tarkvara, vahendeid ja kasulik süstemaatikud. Kõik rakendused ja teenused on jaotatud laiendatav ja otentially hierarhiline süsteem, mis hõlmab peamiste bioloogilise mitmekesisuse teemadel. Sait töötati välja ja esialgu asustatud abiga EDIT WP5. EDIT Samuti tõendab tarkvara peavad olema kooskõlas EDIT oma platvormi Cybertaxonomy, erinevaid tööriistu tuntud tegema koostööd, et aidata taksonoomilise töö.
Pikemas perspektiivis pärast projekti lõppu (~ 2010) me ope saidi haldab kasutajate kogukond.
anonüümsed kasutajad võivad otsida vahendeid ja soovitan uut tarkvara üle vaadata. Nad on ka võimalus esitada bug piletid ja soovitage uusi funktsioone, süsteemi. Kui nad registreerivad ja luua konto, nad võivad kirjutada kommentaare tahes läbivaatuse või isegi kirjutada kommentaare ise, et siis peavad olema eleased avaldamiseks EDIT saidi administraatori poole.
Iga vaadata lehekülg on pühendatud ühe versiooni rakendus või teenus. See annab üksikasju nagu süsteemi nõuete, liideste ja standardite kohta litsentseerimise ning kulude ja kõige olulisem vaadata toimetajad samuti kommentaarid allosas, mis on avatud kõigile.
andmed chaches behinde kahe portaalid on seotud üleilmse GBIF andmete indeksi kaudu "viilu generaator". Kuid selle asemel, paljastades kõik rekordid läbi ühe liidese GBIF ei, portaalid keskenduvad Euroopa ja Saksa botaanilise objekti võrra.Portaalid on pidevalt kättesaadav ajal sünkroniseerimine faasi, kuid võib tekkida mõningaid veidi aeglasem vastuseid nagu tavaliselt.
Euroopa strateegilise foorumi teadustöö infrastruktuuride jaoks (ESFRI) avaldas täna oma valik kõige lootustandvamaid järgmise põlvkonna laiaulatuslike teadusuuringute infrastruktuure. Valdkonnas mitmekesisuse alaseid uuringuid LIFE WATCH (http://www.lifewatch.eu) kava oli valitud. Kava eesmärk on ehitada e-Teadus ja tehnoloogia infrastruktuur bioloogilise mitmekesisuse andmed ja vaatlused.
See algatus on välja töötanud 8 suurema EU teaduslikud võrgustikud on esimene samm realiseerimise infrastruktuuri. See põhineb eelneval arenguid, nagu Global Biodiversity Information Facility (GBIF) ning ühendab vahendid andmete saamist ning koostalitlusvõimet toetavate võrgustike mitmekesisuse observatooriumid (bioloogiliste kollektsioonide ja valdkonnas sites), koos digitaalse laborite pakub analüüsi ja modelleerimise abil.
Life Watch infrastruktuur tõstab palju arenguid. Rikkalikult suurte andmekogumite eri tasanditest mitmekesisuse avab uusi ja põnevaid võimalusi teha uurimistööd. See ulatuslik lähenemisviis toetab mõistmine ja juhtimine ning kliimamuutuste mõju jagamise, kohandamine ja ülesanded bioloogilist mitmekesisust. Infrastruktuuri edendavad ja hõlbustavad lisandväärtuse loomist nii seoses andmete ja töövahendite ning võimaldavad rohkem keskendunud tähelepanu teadusringkondade ühiseid probleeme.
Projekti XML Security Services jaoks BIOCASe esitleb esimese avaliku release projekti tarkvara levitamise. Lisaks põhineb väljatöötatud tarkvara komponente, näiteks stsenaarium on praegu online näidates lahutamatu funktsionaalsust turvateenuseid.
Projekti rahastab Euroopa Liidu projekt SYNTHESYS ja BMBF projekti GBIF-D ja toimub koostöös Botanical Muuseum ja Botaanikaaed Berlin (BGBM) ja Networked Information Systems (NBI).
Meie ülesanne seisneb integratsiooni turvateenused pakub Role Based Access Control ja õiguste haldamise jõustamine ning lisaks konfidentsiaalsuse, terviklikkuse ja autentsuse kohta (allikad) in preexisting XML protokoll keskkonda (BIOCASe). Sest, et mõned spetsialiseerunud XACML komponendid ja poliitika on välja töötatud ja rakendatud koos XML-Signature standard.
Tarkvara rakendati Java ja avaldatud Mozilla Public License (V1.1).
