Structurii chimice uşor, interogare şi de reacţie desen

Structura chimică desen

MarvinSketch permite utilizatorilor să elaboreze rapid molecule prin intermediul funcţiilor de bază cu privire la functionalitatile GUI şi avansate, cum ar fi rasada desen, comenzi rapide personalizabile, grupuri prescurtată, implicit şi şabloane definite de utilizator şi sensibile din punct de context meniuri pop-up.

Atom şi proprietăţi Bond

MarvinSketch are un suport bogat pentru atom şi proprietăţi de obligaţiuni. Utilizatorii pot atribui gratuit stereochimie,, valenta, radicali şi izotopi pentru fiecare atom. Unică, legături duble, triple şi formele aromatice sunt acceptate. Mai mult decât atât parcela folosind ghidul de obligaţiuni poate atribui stereochimie la atomi. Câmpuri de date suplimentare pot fi, de asemenea, ataşat la atomi, prin intermediul "S-grup", logica, astfel încât orice informaţii definite de utilizator pot fi stocate direct cu informaţii structurale.

Reacţie desen

Se pot desena reacţii singur pas în MarvinSketch, prin plasarea unui săgeată reacţie în orice poziţie, indicând în orice direcţie, în ceea ce priveşte produsele de reacţie. Structurile "în faţa" de săgeata vor fi recunoscute ca reactanti, structurile de "sus" pe săgeata de ca agenţi, şi a structurilor din spatele ca produse. Atomii pot fi automat sau manual mapată utilizând funcţia săgeată.

Solicitare de desen

Atom liste, liste de obligaţiuni, nu liste, atomi generice, R-grupuri, perechi solitar se numără printre caracteristicile clădirii interogare disponibile în MarvinSketch.Noduri legătură într-, unităţi de repetarea, atomi pseudo şi grupurile de omologie, S-grupuri cu date tehnice fixată sunt de asemenea suportate. Normele Smarts permit utilizatorilor să definească orice întrebări specifice sau generice.

Tune, combina şi vizualizarea

Plugins Calculator oferă o soluţie la o gamă largă de probleme cu care se confruntă de chimisti medicamente sau de calcul.ChemAxon suita lui Plugin Calculator este un set de instrumente pentru a calcula cheminformatics proprietăţi bazate pe structura si ofera versatilitate şi putere de neegalat în caracterizarea structurilor dumneavoastră. Prin punct de vedere chimic, un limbaj pentru a parametriza şi de a combina rezultatele Calculator Plugin, puteţi vedea rapid o serie de proprietăţi relevante şi argumentele pentru structura sau structurile pe panza pe măsură ce se creează.

Predictori şi Enumerators

Software-ul ChemAxon oferă previziuni rapida si exacta a proprietatilor fizico-chimice de bază, cum ar fi logP, TLI, pKa. Stereoizomeri multiple şi tautomers de fiecare structură de intrare poate fi, de asemenea, generate în conformitate cu ghidul de specificate limite.Din moment ce o parte semnificativă a consumului de droguri ca moleculele sunt acizi slabi sau baze, cu multiple redus de energie de ionizare sau statele tautomeric, structuri de rapida si precisa sau cel mai probabil este util.

Descriptori moleculară

Descriptori Calcularea moleculare includ; indicilor topologici, chei structurale, indici, proprietăţi fizice, zona topologice suprafaţă polare sau descriptorii moleculare suprafaţă cu aplicabilitate largă, atât la activitatea biologică şi Predictii proprietate ADME.Descriptorii pot fi, de asemenea, utilizate pentru clasificare, grupare, filtrare constructii model predictiv.

Modelarea moleculară

ChemAxon oferă o interfaţă simplificată pentru aplicaţii interactive moleculare mecanica, cum ar fi optimizarea ligand 3D si generarea de conformaţie. Aliniere intuitivă şi rapidă 3D şi moleculară Dynamics de control face extrem de important pentru chimisti, atât de calcul şi medicamente. Taxa de distribuţie parţial şi derivaţii acesteia determina multe proprietăţi fizico-chimice ale unei molecule, cum ar fi reactivitate sau model pharmacophore şi pot chemat din interfaţa.

Bine aţi venit în cea mai mare sprijin pentru formatele de fişiere structura chimică

În plus faţă de cele mai multe formate de fişier chimice MarvinSketch poate deschide proteine, fişiere secvenţe de acid nucleic, Gaussian de intrare şi de ieşire fişiere, numele de formate de fişier chimică, JChem fişiere de masă. ChemDraw şi Draw Symyx formate de fişier (SKC, CDX) sunt, de asemenea, recunoscute de Marvin. În spatiului de adrese IP Marvin utilizatorii pot importa, de asemenea, fişiere Markush DARC şi salva toate caracteristicile în cadrul Marvin implicit (MRV) formatul de partajare şi editare ulterioară. Marvin se poate de import şi export molecule unice şi multiple. Structuri din imagini pot fi convertite în MarvinSketch folosind aplicaţia gratuită OSRA.

Manipulări 3D

MarvinSketch acceptă editarea 3D şi de curăţare pe panza. Transformări reglabile 3D şi afişarea de gradul de rotaţie cu axă specifice pot fi uşor de realizat. Regizat îmbinare caracteristică vă permite să conectaţi un fragment selectat într-un alt fragment în conformitate cu perechi alocate atom ajuta remiză molecule mari sau peptide cu precizie.

Structura şi Valence checker

ChemAxon lui Verificator tehnologia Structura este folosit pentru a verifica şi stabili caracteristicile eronate în fişierele de structura chimică în cursul de import sau de fişier deschis. Verificator structura este intens integrat în cadrul Marvin astfel de control şi de stabilire în mod automat în timp ce structurile de remiză. Verificatorul structura poate rula automat o listă personalizabil de fixatori şi fie avertiza sau de a corecta erorile constatate. În modul manual semi-o fereastră separată care vă va deschide printr-o serie de remedii posibile care pot fi aplicate în mod automat.

Lucrul cu grupurile de prescurtată

MarvinSketch oferă o gamă de pre-standard definită prescurtată grupuri care pot fi plasate pe cursorul desen doar prin tastarea primele caractere ale numelui lor. Pe listele de panza vă permit să navigaţi şi să exploreze opţiunile şi utilizatorii pot defini, denumesc şi se stochează grupuri particularizate prescurtată pentru a rafina rapid şi să lucreze mai rapid, cu tipuri de molecule ce sunt de obicei de lucru cu.

Schiţă structura Markush şi reprezentare

MarvinSketch permite utilizatorilor să schiţeze pur structuri Markush sau Thomson Reuters import Markush DARC formate de fişier.Reprezentarea ChemAxon Noul urmează reprezentare IUPAC.

Lucrul cu built-in şi ghidul de biblioteci şablon definit

MarvinSketch prevede mai multe categorii predefinite structura chimică în cadrul biblioteca de şabloane, inclusiv, aminoacizi, cycloalkaynes, polycyclics, şi multe altele.Pentru uşurinţa de utilizare, bara de instrumente şablonul poate fi adus pe interfaţa MarvinSketch astfel încât să puteţi drag and drop structurilor din bibliotecă la panza. Utilizatorii pot defini propriile şabloane în diferite moduri, inclusiv prin glisarea o structura din panza pentru a bara de instrumente şabloane.

Căutare ChemSpider şi baze de date, prin intermediul PubChem MarvinSketch

Mai multe căutări online, baze de date pot accesat direct de la MarvinSketch. Utilizatorii pot executa căutări infrastructura, suprastructura sau similitudine.

Imagine generaţie

MarvinSketch acceptă opţiuni moleculă diverse afişare şi formatare pentru a genera imagini de inalta calitate structura pentru scopuri de raportare sau publicare. Marvin este capabil de a exporta fişiere bitmap ca imagine JPEG, MS BMP, PNG, PPM şi grafică vectorială ca fişiere SVG, PDF şi EMF.

Afişare şi formatare

MarvinSketch acceptă opţiuni moleculă diverse afişare şi formatare pentru a genera imagini de inalta calitate structura pentru scopuri de raportare sau publicare. Prin instrumentele de stil şi stilurile incluse şablonul pe care poate reformata rapid molecule pentru stiluri de jurnal specifice.

Lucrul cu structuri chimice în Microsoft Office

Structuri chimice pot fi salvate ca fişiere imagine şi se introduc în fişierele Microsoft Office. Marvin Obiecte (OLE) sunt, de asemenea, sprijinite de lucru care să permită, cu structuri chimice în documente Microsoft şi prezentări.

Usability

A se vedea numai funcţionalitatea doriţi să le vedeţi în cazul în care doriţi să-l vezi

Puteţi personaliza interfaţa cu utilizatorul MarvinSketch pentru a se potrivi mai bine nevoilor dumneavoastră sau stil, chiar să alegeţi să configuraţi aspect să semene cu alţi editori chimice, cum ar fi ChemDraw sau ISISDraw, inclusiv normele de comenzi rapide lor. De exemplu, aveţi posibilitatea să reorganiza conţinutul bara de meniu şi comandă sau pentru a crea noi bare de meniu. Orice modificări care le efectuaţi vor fi stocate ca implicită următoarea dată când deschideţi Marvin Sketch.

Batch moleculară format de fişier de conversie

Calcule lot şi fişier de conversie format utilizând MolConverter

MolConverter este un program de linie de comandă în Fasole boabe şi Marvin JChem care face conversia între diferite tipuri de fişiere. De operare în modul de lot utilizatorii pot specifica diferite documente, fişiere molecula, grafice şi de compresie / codare formate. Atunci când manipularea structuri chimice utilizatorii pot specifica modul în care să se ocupe de caracteristicile chimice relevante pentru formate de fişier moleculă.