 on üks kõige olulisemaid meetodeid mikroobide ökoloogia, sest see on kõige otsesemalt uurida mikroob maailma enda vaatenurgast at ruumimastaape olulised mikroobid ise. Suur väljakutse mikroobide ökoloogia on arendada usaldusväärse ja ladus meetodeid arvutipõhise mikroskoopia, mida saab analüüsida keerulist digitaalpilte mikroobide populatsiooni ja kogukondadele rakus resolutsioon ja arvutama ökoloogiliselt olulised kvantitatiivsed omadused nende arvukus, ruumilise korralduse ning mitmekesisus ilma viljelemiseks. On mitmeid eeliseid kasutades kujutuvastuseks tehnikaid koos arvuti abil mikroskoopia ja digitaalse kujutise analüüs kvantitatiivseid uuringuid mikroobide kogukondi.Automaatne kujutise analüüs vähendab tüütu töö mikroskoobid vaja täpselt mõõta mikroobide arvukus ja nende morphotype klassifikatsioon in situ .Need meetodid läbi CMEIAS pakkuda võimas kvantitatiivset lähenemist analüüsida ecophysiological ja ruumilise funktsioone, mis täiendab molekulaarne mikroobide ökoloogia lähenemisi analüüsida keerulist mikroobide kogukondade kohapeal ilma viljelemiseks.
 tarkvara on välja töötanud meeskond mikroobide ökoloogia, arvuti teadlasi ja matemaatikuid MSU Center for mikroobide ökoloogia . Analüüsivahendeid koosneda mitmest custom plug-ins, et meil on ehitatud UTHSCSA ImageTool , free image analüüsi tarkvara tegutsevad isikliku arvuti töötab 32-bit Windows operatsioonisüsteemi.CMEIAS Ver. 1,27 objekti analüsaator ekstraktid kasutaja poolt valitud kombinatsioonis kuni 34 mõõtmist atribuute (suurus, kuju, heleduse ja ruumilised koordinaadid) iga esiplaani objekti leida pildi. CMEIAS / IT 1-mõõtmeline objekt klassifitseerija valikuliselt rühmade objektide pildi kuni 16 prügikastidesse põhineb jaotus skaalal määratletud ladvik piire üksik mõõtmine funktsioon, ühikutes määratletud kasutaja määratud ruumilise kalibreerimine. CMEIAS morphotype klassifitseerija automaatselt liigitab iga esiplaani objekti pildil ühte 11. ülekaalus mikroobide morphotypes , sealhulgas kokid, spiraalid, kaarjad latid, U-kujuline latid, regulaarne sirged kepikesed hargnemata kiud, ellipsoidid, klubid, vardad laiendatud prostheca, algeline hargnenud vardad ja hargnenud kiud. CMEIAS kujutise analüüs programmi ja põhjaliku testimise tulemustest morphotype klassifikatsioon algoritmid üksikasjalikult kirjeldatud Liu et al . 2001 .
Ver. 1,27 tarkvara on välja antud tasuta allalaaditav plug-ins, et ta saaks pakkuda laia rakendamist mikroobide ökoloogia teadusuuringuid, koolitust ja haridust. Terviklik operaator käsitsi pluss interaktiivne koolitus õpetused pakkuda taustinformatsiooni ja juhiseid selle tarkvara kasutamiseks on kaasas CMEIAS Ver. 1,27 program files saadavalallalaadimiseks ala .
Uus eraldi CMEIAS Color Segmentation rakenduse tööriistakomplekt on nüüd võimalik lihtsustada pilditöötlus ülesanded peavad segment ja analüüsida esiplaanil objektide kompleks pilte.
Suur CMEIAS Image Analysis upgrade on valmimisel ja peagi saadaval tulevikus. Registreeru ja liitu meie meililistiga saada CMEIAS uudiseid värskendused. |
